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莫西沙星耐药的艰难梭菌多重聚合酶链反应检测和基因分型

莫西沙星耐药的艰难梭菌多重聚合酶链反应检测和基因分型

作     者:黄丽清 肖克林 周天祥 王中兴 孔繁荣 Huang Liqing;Xiao Kelin;Zhou Tianxiang;Wang Zhongxing;Kong Fanrong

作者机构:深圳市宝安区妇幼保健院检验科518133 深圳市宝安区妇幼保健院中心实验室518133 悉尼大学Westmead医院感染性疾病和微生物中心 

基  金:宝安区科技计划项目 

出 版 物:《中华传染病杂志》 (Chinese Journal of Infectious Diseases)

年 卷 期:2015年第33卷第5期

页      码:290-293页

摘      要:目的:建立一种多重 PCR 方法用于莫西沙星耐药的艰难梭菌鉴定和初步基因分型。方法根据艰难梭菌 slpA 可变区间核苷酸序列的差异设计5种 slpA 基因型(gr、hr、fr、gc08和078)的特异性 PCR 引物,同时加入检测艰难梭菌管家基因磷酸甘油醛异构酶基因 tpi 的种特异性引物,构建多重PCR 方法;利用9种肠道常见的正常或致病菌验证多重 PCR 方法的特异性,利用46株分属于11个slpA 基因型的艰难梭菌参考菌株来验证方法的检测和分型能力;利用建立的多重 PCR 方法检测39株莫西沙星耐药的临床菌株,以 slpA 测序分型法为参照方法,评估该方法的临床实用性。结果多重PCR 检测9种肠道常见的正常或致病菌 tpi 和5种 slpA 基因型均为阴性;46株艰难梭菌参考菌株 tpi均为阳性,36株分属于5种靶 slpA 基因型(gr、hr、fr、gc08和078)的菌株被正确分型,10株分属于其他6种基因型的参考菌株均无法分型。39株莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株 tpi 均为阳性,32株检出具体基因型,其中22株为 slpA 基因型 gc08,6株为 hr,2株为 fr,2株为078,与 slpA 测序分型结果一致;7株多重 PCR 无法分型,slpA 测序分型结果显示其基因型均不包含在多重 PCR 分型范围内。结论成功建立一种简单、快捷、临床实验室适用的艰难梭菌检测,且能够分辨出5种 slpA 基因型的多重PCR 方法;莫西沙星耐药的艰难梭菌主要为 slpA 基因型 gc08。

主 题 词:梭菌 难辨 表面膜蛋白A 基因分型 多重聚合酶链反应 

学科分类:100208[100208] 1002[医学-临床医学类] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2015.05.009

馆 藏 号:203720642...

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