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中蜂囊状幼虫病毒LN-QY株VP_2结构蛋白的基因分析及B细胞抗原表位预测

中蜂囊状幼虫病毒LN-QY株VP_2结构蛋白的基因分析及B细胞抗原表位预测

作     者:张琳 钱爱东 毛靖宇 ZHANG Lin;QIAN Aidong;MAO Jingyu

作者机构:吉林农业大学吉林长春130118 赤峰市翁牛特旗医院检验科内蒙古赤峰024000 

出 版 物:《辽宁医学院学报》 (Journal of Liaoning Medical University (LNMU) Bimonthly)

年 卷 期:2012年第33卷第5期

页      码:407-410,436,I0003,I0004页

摘      要:目的预测中蜂囊状幼虫病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)LN-QY株VP2蛋白的空间结构及其B细胞抗原表位。方法将已感染CSBV LN-QY株的RNA作为模板,进行RT-PCR扩增该毒株结构蛋白VP2基因,再与pMD18-T载体连接,之后转化大肠杆菌DH5α感受态,对经EcoRⅠ和BamH I双酶切鉴定为阳性的重组质粒进行测序,通过序列比对,获得LN-QY株VP2的核苷酸序列和推导的氨基酸序列,建立VP2结构蛋白的3D模型,在此基础上,应用DNAStar软件中的Protean模块综合分析结构蛋白的柔性区域、亲水性、表面可能性以及抗原指数等参数。结果 VP2结构蛋白的空间构象比较规则,其可能的B细胞抗原表位区域位于178-184,144-199,211-217氨基酸区段。结论本研究为CSBV LN-QY株VP2蛋白表位疫苗的设计以及血清诊断试剂盒的研制奠定了理论基础。

主 题 词:中蜂囊状幼虫病毒 VP2结构蛋白 空间结构 B细胞表位 预测 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.3969/j.issn.1674-0424.2012.05.009

馆 藏 号:203725906...

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