荧光定量PCR对FEN1敲低细胞株转录组测序结果的验证

作     者：苏倩 吴洁 杜佳慧 杨凡 袁濮玉 刘松柏 邱秀芹 SU Qian;WU Jie;DU Jiahui;YANG Fan;YUAN Puyu;LIU Songbai;QIU Xiuqin

作者机构：苏州卫生职业技术学院苏州检验医学生物技术重点实验室 

基　　金：国家自然科学基金项目(31701198) 江苏省自然科学基金项目(BK20170386) 江苏省高层次卫生人才“六个一工程”拔尖人才科研项目(LGY2018087) 江苏省高等学校自然科学研究面上项目(17KJB180013) 江苏省教育厅大学生实践创新训练项目(201712688006Y) 苏州卫生职业技术学院科技创新团队项目(SZWZYTD201804) 苏州卫生职业技术学院课题(SZWZY201804) 江苏高校“青蓝工程”优秀青年骨干教师培养项目(2017) 

出 版 物：《重庆医学》 (Chongqing medicine)

年 卷 期：2019年第48卷第15期

页      码：2528-2531页

摘      要：目的探讨DNA分枝结构特异性内切酶-1(FEN1)基因敲低细胞株及对照细胞株的差异表达基因,用实时荧光定量PCR方法进行结果验证。方法从293T野生型及293T FEN1敲低细胞株中提取RNAs,并反转录成cDNA;挑选10个转录组测序中差异表达的基因,设计引物,利用SYBR Green染料法,定量检测挑选基因的表达情况。结果挑选的10个差异表达基因中,成功扩增了其中7个基因;通过实时荧光定量PCR方法对两组细胞的7个基因进行定量检测发现,与转录组测序结果相比较,其中有2个没有明显差异,另外5个基因荧光定量方法的检测结果与转录组测序结果一致。结论在细胞内基因表达水平检测中,为提高转录组测序结果的可靠性,还需通过实时荧光定量PCR方法对其结果进一步验证。

主 题 词：荧光定量PCR FEN1 RNA,信使 转录组 测序 基因敲低技术 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1671-8348.2019.15.003

馆 藏 号：203727254...