山西省吉县刺槐无性系种质遗传多样性的EST-SSR分析

作     者：李秀宇 郭琪 董黎 孙宇涵 牛东升 刘佳平 王红生 李云 Li Xiuyu;Guo Qi;Dong Li;Sun Yuhan;Niu Dongsheng;Liu Jiaping;Wang Hongsheng;Li Yun

作者机构：林木分子设计育种高精尖创新中心刺槐工程技术研究中心林木育种国家工程实验室北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 吉县刺槐种子园山西吉县042200 

基　　金：国家自然科学基金项目(31570677) 国家重点研发课题(2017YFD0600503) 北京林业大学重大科研成果培育项目(2017CGP007) 国家林业局科技发展中心项目(2016007) 

出 版 物：《北京林业大学学报》 (Journal of Beijing Forestry University)

年 卷 期：2019年第41卷第7期

页      码：39-48页

摘      要：【目的】了解各对EST-SSR引物检出的等位简单序列重复片段数量,解析吉县良种基地刺槐无性系种质的多态性状况与种质间亲缘关系,为引物利用和刺槐种质遗传管理提供参考。【方法】利用课题组开发的45对EST-SSR引物进行PCR扩增,使用毛细管电泳仪对产物进行检测,用Popgene 1.32版软件对群体遗传参数进行评估,利用NTsys 2.10e进行聚类分析。【结果】45对EST-SSR引物中,除了引物RP-24均表现出良好的多态性。44对引物共检测到等位重复序列298个,每对引物检测到2~15个,平均6.77个。群体观测杂合度(Ho)的变化范围为0.022 7~0.842 1,平均为0.412 6。期望杂合度(He)的变化范围为0.088 7~0.822 3,平均为0.484 0。引物多态性信息量(PIC)变化范围为0.085 2~0.796 6,平均为0.444 4。【结论】该基地的刺槐无性系种质具有较高的遗传多样性。由聚类结果可知,在遗传距离为0.81时,可将96份刺槐无性系种质聚成5类。聚类图在分子水平上显示了刺槐无性系种质间的亲缘关系,研究结果对于利用这些引物用于刺槐的种质评价、资源管理和辅助育种有积极的参考价值。

主 题 词：刺槐 EST-SSR 遗传多样性 聚类分析 

学科分类：0907[农学-草药学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 

核心收录：

D　O　I：10.13332/j.1000-1522.20190108

馆 藏 号：203729887...