基于梨贝壳杉烯氧化酶基因PpKO序列的功能性SNP标记

作     者：田义轲 王彩虹 白牡丹 殷豪 李节法 

作者机构：青岛农业大学园林园艺学院山东青岛266109 

基　　金：山东省自然科学基金项目(Y2008D51) 山东省良种工程项目 山东省科技发展计划项目(2011GNC11018) 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2012年第39卷第10期

页      码：1876-1884页

摘      要：基于基因序列的功能性标记是基因分型、图谱定位和相关性状标记辅助选择的理想标记。以 矮生梨 × 茌梨 的梨杂交分离群体和9个梨栽培品种为试材,以梨赤霉素合成代谢途径的关键酶基因--贝壳杉烯氧化酶基因(PpKO)的cDNA序列为基础,设计5对PCR引物,通过高通量熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析,筛选到可对基因进行良好分型的1对引物。通过对杂种后代和测试品种的测序分析表明,此对引物的扩增子是一个位于PpKO第8外显子上的长度为200bp的序列,从中共检测到两处单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)变化,且均为非同义cSNP。这两处SNP标记均可以作为适合高通量分析的遗传标记在遗传作图、基因定位或资源鉴定中加以利用。

主 题 词：梨 单核苷酸多态性 功能性标记 贝壳杉烯氧化酶基因 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

核心收录：

D　O　I：10.16420/j.issn.0513-353x.2012.10.032

馆 藏 号：203734783...