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细角螺微卫星DNA富集文库构建及特征分析

细角螺微卫星DNA富集文库构建及特征分析

作     者:李清荟 陈晓姣 黎中宝 曹媛钰 陈丽娜 戴刚 LI Qing-hui;CHEN Xiao-jiao;LI Zhong-bao;CAO Yuan-yu;CHEN Li-na;DAI Gang

作者机构:集美大学水产学院福建厦门361021 福建省海洋渔业资源与生态环境重点实验室福建厦门361021 

基  金:集美大学创新团队基金项目(2010A004) 

出 版 物:《海洋科学》 (Marine Sciences)

年 卷 期:2013年第37卷第4期

页      码:1-5页

摘      要:采用生物素磁珠富集法,用生物素标记的(GT)15和(CT)15两种探针与细角螺基因组MseI酶切的300~1200bp片段杂交,杂交复合物与链霉亲和素磁珠结合,捕获含有重复序列的微卫星片段。最后将磁珠捕获到的重复序列与PMD19-T载体连接后克隆到DH5α中构建微卫星基因组文库。通过PCR检测出354个阳性克隆,从中随机选取248个片段大于500bp的阳性克隆进行测序,结果显示,在220个成功测序的阳性克隆中共获得278个微卫星序列,其中完美型171个,占61.5%;非完美型81个,占29.1%;复合型26个,占9.4%。除探针使用的GT和CT的重复序列外,还筛选到三碱基GTT、TGG、GAA、CAA;四碱基TCTA、ACAG、TAGA、GTGA、GTCT、GATA及五碱基TTTTG的重复序列。在278条序列中共有82条可以设计引物。

主 题 词:细角螺(Hemifusus ternatanus) 磁珠富集 微卫星 构建 DNA文库 

学科分类:0908[0908] 09[农学] 

核心收录:

馆 藏 号:203735048...

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