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焦磷酸测序技术在检测甲型H1N1血凝素基因裂解位点突变中的应用

焦磷酸测序技术在检测甲型H1N1血凝素基因裂解位点突变中的应用

作     者:陈晓光 程琳 郭宁 姜华 张瑾 金燕 梁洁 张娟 

作者机构:山东国际旅行卫生保健中心山东青岛266007 

出 版 物:《中国国境卫生检疫杂志》 (Chinese Journal of Frontier Health and Quarantine)

年 卷 期:2014年第37卷第3期

页      码:186-189,193页

摘      要:目的基于焦磷酸测序技术建立甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因裂解位点突变的快速检测方法,探讨其临床应用价值。方法采用RT-PCR扩增甲型H1N1病毒血凝素基因中的HA片段,在生物信息学分析的基础上,针对甲型H1N1病毒血凝素基因含有裂解位点序列片段,分别设计一套生物素标记的PCR引物和测序引物,运用焦磷酸测序技术对含甲型H1N1病毒裂解位点基因片段进行序列测定,同时分析青岛地区甲型H1N1流感病毒流行株的裂解位点基因特征。结果建立了基于焦磷酸测序技术检测甲型H1N1流感病毒裂解位点突变方法,实现甲型H1N1流感病毒HA基因裂解位点的高通量检测,青岛地区甲型H1N1流感病毒裂解位点344氨基酸序列没有发生变异。结论本研究所建立的方法具有自动化程度高和结果准确等特点,适用于甲型H1N1流感病毒裂解位点进行快速高通量检测。

主 题 词:焦磷酸测序技术 甲型H1N1流感病毒 血凝素(HA)基因 突变 裂解位点 

学科分类:1010[医学-医学技术类] 10[医学] 

D O I:10.16408/j.1004-9770.2014.03.015

馆 藏 号:203735505...

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