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显微CT血管系统三维结构的骨架细化算法并行化设计实现

显微CT血管系统三维结构的骨架细化算法并行化设计实现

作     者:谭海 王大东 薛艳玲 王玉丹 杨一鸣 肖体乔 Tan Hai;Wang Dadong;Xue Yanling;Wang Yudan;Yang Yiming;Xiao Tiqiao

作者机构:中国科学院上海应用物理研究所上海201800 中国科学院大学北京100049 澳大利亚联邦科学与工业研究组织 

基  金:CAS-CSIRO国际合作项目(GJHZ1303) 国家自然科学基金(81430087 11405260 11475248) 国家自然科学基金联合重点项目(U1232205) 国家973计划(2010CB834301) 

出 版 物:《光学学报》 (Acta Optica Sinica)

年 卷 期:2015年第35卷第11期

页      码:253-259页

摘      要:提取骨架是计算机断层扫描(CT)三维(3D)血管图像定量分析中的关键步骤,通常耗费数小时,直接制约了图像分析的定量研究。分析串行骨架细化算法各步骤中包含的可并行化操作,对其进行并行化设计,提出的算法通过Open MP多线程技术实现,并采用不同大小的三维CT血管图像进行分析和测试。根据测试结果,改进后的算法获取到的骨架准确可靠,对于1.95 GB大小的三维血管图像,使用16个线程进行并行运算时,可将运算时间由176min缩短到13 min,时间消耗上降低了一个数量级。因此,提出的方法可实现大型血管骨架的准确、高效提取,解决了大型三维图像分析问题中运算效率低这一瓶颈问题。

主 题 词:医用光学 三维骨架 细化 并行处理 Open MP 加速比 

学科分类:0810[工学-土木类] 0808[工学-自动化类] 0809[工学-计算机类] 08[工学] 0805[工学-能源动力学] 081002[081002] 0702[理学-物理学类] 

核心收录:

D O I:10.3788/aos201535.1117003

馆 藏 号:203736215...

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