幽门螺杆菌分离株iceA基因克隆及序列分析

作     者：马一君 段广才 张荣光 范清堂 张卫东 郗园林 朱静媛 

作者机构：郑州大学公共卫生学院流行病学教研室河南郑州450001 河南中医学院基础医学院微生物教研室 河南省分子医学重点学科开放实验室 

出 版 物：《中国公共卫生》 (Chinese Journal of Public Health)

年 卷 期：2010年第26卷第8期

页      码：991-992页

摘      要：目的克隆幽门螺杆菌中国郑州市慢性萎缩性胃炎患者分离株MEL-Hp27iceA基因,测序后对其进行序列分析。方法根据iceA基因上下游基因序列设计引物,PCR扩增iceA基因,并将其连接至pMD19-T载体,测序后采用相关数据库和生物信息学软件对基因序列进行分析。结果成功克隆幽门螺杆菌Hp27菌株iceA基因序列,扩增产物大小约为790 bp;重组质粒pMD19-T-iceA单酶切产生3 820 bp片段,双酶切产生3 000和820 bp的2个片段;Hp27iceA基因与大多数美国来源菌株同源性>85%,与日本、印度等地区来源菌株同源性<70%。序列分析结果表明,所克隆到的基因为iceA2亚型,与美国株Alaska strain 219、Alaska strain 213关系最近,同源性分别为87%和95%,与芬兰株Finland strain 9496等菌株存在聚类关系,同源性88%～93%,与CR9等其他菌株距离较远。结论成功克隆幽门螺杆菌Hp27菌株iceA基因序列;不同地区幽门螺杆菌分离株的iceA基因间存在着一定差异。

主 题 词：幽门螺杆菌 iceA基因 克隆 序列分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

馆 藏 号：203742830...