原核表达中优化起始密码下游序列的软件设计与实现

作     者：许龙 李涛 周晓巍 黄培堂 XU Long;LI Tao;ZHOU Xiao-Wei;HUANG Pei-Tang

作者机构：军事医学科学院生物工程研究所北京100071 军事医学科学院国家生物医学分析中心北京100850 

出 版 物：《生物工程学报》 (Chinese Journal of Biotechnology)

年 卷 期：2006年第22卷第6期

页      码：1032-1035页

摘      要：在原核表达中影响外源基因表达效率的因素有很多,这其中翻译起始效率起了非常重要的作用。翻译起始效率又主要受SD序列、SD序列与起始密码子之间的间距、DB(DownstreamBox)序列、mRNA翻译起始区(TIR)的二级结构和稀有密码子等因素的影响。主要针对DB序列和5′端稀有密码子的优化设计了软件。通过计算机对序列进行分析比对后,按照匹配碱基数、匹配位置、密码子使用频率平均值的顺序进行排序,给出一些优化序列,并给出了软件算法。

主 题 词：DB序列 16SrRNA 序列匹配性 基因表达 软件设计 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:1000-3061.2006.06.028

馆 藏 号：203747643...