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2006—2007年陕西省古典猪瘟流行毒株E0基因的克隆及序列分析

2006—2007年陕西省古典猪瘟流行毒株E0基因的克隆及序列分析

作     者:吴旭锦 朱小甫 陈德坤 WU Xu-jin;ZHU Xiao-fu;CHEN De-kun

作者机构:咸阳职业技术学院生物科技系陕西咸阳712000 西北农林科技大学动物医学院陕西杨凌712100 

出 版 物:《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 (Journal of Zhejiang University:Agriculture and Life Sciences)

年 卷 期:2010年第36卷第1期

页      码:16-22页

摘      要:根据GenBank上发表的古典猪瘟参考毒株Shimen毒株全基因组序列,设计并合成2对引物,采用巢式RT—PCR技术,从陕西省猪病料中成功扩增出9株猪瘟流行毒株助全基因并测定其核苷酸序列。与已发表的ALD、Alfort187、Brescia、CHVRI、CAP、Shimen、GXWZ02和HCLV等代表毒株进行同源性比较分析.核苷酸分析表明:这9株猪瘟流行毒株可以分为2大群,1株(LN163)属于群Ⅰ,与Shimen强毒株、HCI。V疫苗株和GXWZ02野毒株等代表株的同源性为80.8%~82.4%;另外8株属于群Ⅱ,毒株之间EO基因核苷酸序列的同源性为93.6%~99.6%.氨基酸序列分析表明:9株流行毒株中,群Ⅰ中的LN163毒株与我国野毒参照株GXWZ02的同源性只有83.9%,而其余8株与GXWZ02株氨基酸序列的同源性为94.4%~98.1%,形成明显不同的进化分支;同时这9株流行毒株与我国疫苗株HCLV和经典强毒株Shimen的氨基酸序列同源性分别为88.0%~89.5%和89.1%~91.8%,均呈现较明显的变异.

主 题 词:古典猪瘟 E0基因 克隆 序列分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 090601[090601] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0906[农学-水产类] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3785/j.issn.1008-9209.2010.01.003

馆 藏 号:203748830...

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