SEN病毒中国分离株基因克隆及序列分析

作     者：杜娟 王海平 孟庆华 李娅 詹林盛 王全立 

作者机构：军事医学科学院野战输血研究所北京100850 北京市佑安医院肝病三科北京100011 军事医学科学院附属医院北京100039 

出 版 物：《军事医学科学院院刊》 (Bulletin of the Academy of Military Medical Sciences)

年 卷 期：2003年第27卷第6期

页      码：419-421,431页

摘      要：目的 :测定SENV_D亚型中国分离株的基因组序列 ,并对其进行初步分析。方法 :根据国外已发表的SEN病毒基因序列设计特异性引物 ,应用套式PCR方法从一份非甲_非戊型 (non_A_E)肝炎患者血清中 ,分段扩增了包括SENV_D型所有编码区 (ORFs)长 3175bp的DNA片段 ,将其克隆到T载体后测序。结果 :测序结果经BLAST软件分析 ,与国外发表的 3株D型SEN病毒SENV_D(AX0 2 5 730 ) ,SENV_D(AB0 5 935 2 ) ,TTV(AB0 2 86 6 8)的核苷酸序列同源性分别为 90 % ,88%和 91% ;与 2株D型SEN病毒SENV_D(AX0 2 5 730 ) ,TTV(AB0 2 86 6 8)ORF1所编码蛋白的氨基酸同源性分别为 93%和 92 %。ORF1蛋白中含有Rep蛋白 (在病毒复制中起作用的一种蛋白 )的两个保守基序 ,此外还有一个保守的ATP GTP结合基序 (P_loop)以及若干个高度保守的蛋白激酶磷酸化位点。结论 :测定得到了SENV_D亚型中国分离株的基因组序列 ,有助于其检测方法及致病性的研究 ,并为研究SEN病毒的进化地位提供方便。

主 题 词：基因组 病毒 非甲-非戊型肝炎 SEN病毒 聚合酶链反应 序列分析 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1674-9960.2003.06.007

馆 藏 号：203756565...