青石斑鱼MHCclassI基因的克隆与分析

作     者：王海燕 刘勇 张甲 张冰 WANG Hai-yan;LIU Yong;ZHANG Jia;ZHANG Bing

作者机构：中国农业大学动物医学院北京100094 

出 版 物：《中国比较医学杂志》 (Chinese Journal of Comparative Medicine)

年 卷 期：2008年第18卷第11期

页      码：14-20页

摘      要：目的克隆青石斑鱼MHCclassI基因,为研究石斑鱼的免疫系统和MHCclassI基因库提供材料。方法首先利用MHCclassI基因的特征,根据已知MHCclassI基因及其特点设计简并引物得到MHCclassI部分序列,然后分别利用5′RACE、3′RACE延伸至全基因的两端。将得到的序列拼接,经NCBI上BLASTx分析青石斑鱼MHCclassI基因核心区域,设计引物得到青石斑鱼MHCclassI基因。最后,将所得MHCclassI基因所对应氨基酸与几种鱼和人类MHCclass分子利用DNAMAN和MEGA软件分别进行比对和绘制分子进化树。结果成功得到青石斑鱼5个MHCclassI基因和绘制了MHCclassI分子进化树。同源性分析发现5个MHCclassI基因氨基酸同源性85.69%即高度的多变性。经氨基酸序列分析,青石斑鱼与已知鱼类和人MHCclassI基因的氨基酸序列存在30.27%～73.46%同源性其中不同鱼类同源性比对的比值表现为不同种类的鱼亲缘关系越近同源性比值越高。结论青石斑鱼MHCclassI基因具有已知物种MHCclassI基因特征。MHCclassI分子可以为生物进化分析提供依据。

主 题 词：青石斑鱼 MHCclassI 进化指征 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1671-7856.2008.11.004

馆 藏 号：203758238...