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一种采用知识打分函数的分子对接方法

一种采用知识打分函数的分子对接方法

作     者:王希诚 赵晓宇 康玲 李洪林 WANG Xi-cheng;ZHAO Xiao-yu;KANG Ling;LI Hong-lin

作者机构:大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室辽宁大连116024 大连理工大学工程力学系辽宁大连116024 大连理工大学计算机科学与技术学院辽宁大连116024 中国科学院上海药物研究所上海201203 

基  金:国家自然科学基金资助项目(10772042) "八六三"国家高技术研究发展计划资助项目(2006AA01124) 

出 版 物:《大连理工大学学报》 (Journal of Dalian University of Technology)

年 卷 期:2010年第50卷第2期

页      码:157-161页

摘      要:分子对接是计算机辅助药物分子优化设计的重要组成部分.引入了一种通过计算原子对间距离来评价结合自由能的知识打分函数,其构造方法与平均力势能函数相似.同时采用基于信息熵的多种群自适应遗传算法,形成一种新型的分子对接程序KGAsDock.给出与著名的分子对接程序DOCK6.1的对接结果比较,数值实验表明,该算法在不降低计算效率的前提下,提高了对接的精度.

主 题 词:分子对接 知识打分函数 遗传算法 优化模型 

学科分类:0810[工学-土木类] 12[管理学] 1201[管理学-管理科学与工程类] 081104[081104] 08[工学] 0805[工学-能源动力学] 0835[0835] 0704[理学-天文学类] 0701[理学-数学类] 0811[工学-水利类] 0812[工学-测绘类] 

核心收录:

馆 藏 号:203764296...

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