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岩原鲤微卫星富集文库的构建及微卫星分子标记的筛选

岩原鲤微卫星富集文库的构建及微卫星分子标记的筛选

作     者:袁慧 张修月 宋昭彬 岳碧松 YUAN Hui;ZHANG Xiu-yue;SONG Zhao-bin;YUE Bi-song

作者机构:四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室四川大学生命科学学院成都610064 

基  金:国家自然科学基金资助项目(编号:30670290) 

出 版 物:《四川动物》 (Sichuan Journal of Zoology)

年 卷 期:2008年第27卷第2期

页      码:210-215页

摘      要:用磁珠富集法构建了岩原鲤Procypris rabaudi AC重复和GATA重复的微卫星富集文库。采用PCR方法分别以人工合成的oligoA和探针(AC)12或(GATA)6为引物筛选含有微卫星的阳性克隆。(AC)n富集库和(GA-TA)n富集库的阳性克隆率分别为30%和7%左右。对40个AC重复的阳性克隆和30个GATA重复的阳性克隆测序,共获得61个微卫星序列,其中包含了一个三碱基重复(TGA)的微卫星序列。选择设计了19对AC重复和16对GATA重复的微卫星引物以及1对TGA重复的微卫星引物,通过PCR优化,共有20对引物能够产生稳定、清晰的目的产物带。为了检测获得的岩原鲤微卫星座位是否能用于近缘物种的研究,我们将20对岩原鲤微卫星引物用于中华倒刺鲃Spinibarbus sinensis基因组DNAPCR扩增,有60%的引物对能产生特异性的目的条带。本研究获得的20个岩原鲤微卫星座位可以用于岩原鲤及近缘物种的遗传多样性、种群遗传结构等的进一步研究。

主 题 词:岩原鲤 富集文库 微卫星 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 071002[071002] 

核心收录:

馆 藏 号:203772613...

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