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基于近红外光谱的人工神经网络研究STR基因座分型方法

基于近红外光谱的人工神经网络研究STR基因座分型方法

作     者:袁高林 任丽 高玉振 汪维鹏 鄂翔 谢洪平 

作者机构:苏州大学医学部药学院江苏苏州215123 苏州大学医学部法医学系江苏苏州215123 

基  金:国家大学生创新性实验计划资助项目(57315425) 

出 版 物:《分析测试学报》 (Journal of Instrumental Analysis)

年 卷 期:2009年第28卷第11期

页      码:1245-1249页

摘      要:以D16S539基因座的3种(9-9、9-11、11-11)基因型为例,设计引物扩增包含该多态性位点的1段DNA片段,获得了3种基因型建模样本各50个。基于近红外光谱(NIRS)结合误差反向传播人工神经网络(BPANN)建立了测定短串联重复序列(STR)基因型的判别模型,所建立的判别模型的校正均方根残差和预测集均方根误差分别为0.082 5、0.072 5,预测准确率均为100%。该方法不需任何前处理,只需一步PCR扩增和NIRS检测即可实现STR基因型判别,具有简单、快速、低成本等优点。

主 题 词:近红外光谱 人工神经网络 短串联重复序列 基因型 

学科分类:12[管理学] 1201[管理学-管理科学与工程类] 081704[081704] 07[理学] 081104[081104] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 070302[070302] 0835[0835] 0703[理学-化学类] 0811[工学-水利类] 0812[工学-测绘类] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1004-4957.2009.11.004

馆 藏 号:203772955...

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