凝血因子Xa的S4口袋部分关键残基对利伐沙班结合的不同作用机制

作     者：瞿思颖 徐沁 QU Siying;XU Qin

作者机构：上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室 

基　　金：国家自然科学基金(批准号:31770772)资助~~ 

出 版 物：《高等学校化学学报》 (Chemical Journal of Chinese Universities)

年 卷 期：2019年第40卷第9期

页      码：1918-1925页

摘      要：通过生物信息学对比、分子动力学模拟和结合自由能计算分析了利伐沙班与凝血因子Xa的S4口袋部分关键残基之间动态相互作用的细节.结果表明,利伐沙班与凝血因子Xa结合不稳定是由S4口袋关键残基突变对疏水盒子完整性的破坏所致.其中Trp215侧链的疏水作用对抑制剂结合的作用较大,但对整体结构的影响短时间内较小. Tyr99虽然在结合自由能中贡献较小,但其突变可能导致99 loop所在结构域的整体构象变化,从而对于抑制剂或底物的结合特异性产生影响. S4口袋关键残基的不同作用在凝血因子Xa直接抑制剂的药物设计及其拮抗剂的开发中应予以充分考虑.

主 题 词：凝血因子Xa 利伐沙班 S4口袋 分子动力学模拟 结合自由能 

学科分类：081704[081704] 07[理学] 070304[070304] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 

核心收录：

D　O　I：10.7503/cjcu20190261

馆 藏 号：203777557...