水稻条斑病菌内源质粒分析

作     者：曾晨 李康佳 尹朝群 牛祥娜 赵嘉城 朱平川 姜伟 何勇强 ZENG Chen;LI Kang-jia;YIN Chao-qun;NIU Xiang-na;ZHAO Jia-cheng;ZHU Ping-chuan;JIANGWei;HE Yong-qiang

作者机构：亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室/广西大学生命科学与技术学院 

基　　金：国家重点研发计划项目(2018YFD02003021) 国家自然科学基金项目(31660505) 公益性行业(农业)科研专项(201303015) 

出 版 物：《南方农业学报》 (Journal of Southern Agriculture)

年 卷 期：2019年第50卷第8期

页      码：1718-1727页

摘      要：【目的】明确水稻条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzicola,简称Xoc)内源质粒分布状况、类型及其含有的主要功能基因,为下一步开展该菌与质粒相关的毒力进化研究、抗逆机制分析及穿梭载体构建打下基础。【方法】采用数据库检索法和质粒分离鉴定法,调查水稻条斑病菌内源质粒的分布状况;以GenBank数据库中Xoc菌株基因组序列为研究对象,开展质粒信息检索,并对已发表的Xoc内源质粒序列进行系统进化分析;以Xoc中国菌株菌种库为研究对象,采用碱裂解法提取质粒,进行质粒酶切带型分析和主要功能基因鉴定。【结果】GenBank全基因组数据库中Xoc菌株内源质粒检出率为11.76%,系统进化分析结果表明这些质粒属于不同的进化分支。在257株Xoc中国菌株中,有29株菌株含有质粒,质粒检出率为11.28%,带有内源质粒的菌株均来自于华南稻区,且大部分来自广西。通过质粒酶切图谱比较,确认新发现的质粒属于9种新型Xoc内源质粒。按照已知Xoc内源质粒pXOCgx01上主要功能基因序列设计引物,PCR扩增结果表明新鉴定的Xoc质粒含有重金属抗性和DNA转移相关的基因,但在菌株间存在明显的多样性。【结论】部分Xoc菌株中含有一定数量的内源质粒,质粒类型和所含功能基因等具有一定的多样性,携带内源质粒的Xoc菌株有明显地域性。

主 题 词：水稻条斑病菌 内源质粒 调查 酶切图谱 抗逆基因 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

D　O　I：10.3969/j.issn.2095-1191.2019.08.10

馆 藏 号：203778737...