MITE转座子在不同甘蓝型油菜品种中的多态性研究

作     者：安素妨 李保全 鲁丹丹 李高原 侯锦娜 AN Sufang;LI Baoquan;LU Dandan;LI Gaoyuan;HOU Jinna

作者机构：河南省农业科学院作物设计中心郑州450002 华中农业大学信息学院武汉430071 

基　　金：国家重点研发计划“七大农作物育种”专项(2018YFD0100600) 国家自然科学基金青年基金(31501341) 河南省重点研发与推广专项(科技攻关182102110136) 河南省农业科学院优秀青年科技基金(2016YQ29) 

出 版 物：《西北植物学报》 (Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica)

年 卷 期：2019年第39卷第8期

页      码：1389-1399页

摘      要：微型反向重复转座因子(MITE)在真核生物基因组中普遍存在,其活动能够在物种内形成丰富的多态性,在基因组进化和基因调控中均发挥重要作用。该研究利用286对不同MITE家族侧翼序列筛选的特异引物,对101个中国油菜、27个加拿大油菜和29个合成油菜品系(共157个品系)的基因组DNA进行多态性研究,以明确MITE家族的插入/缺失多态性以及在不同油菜品种之间插入的遗传多样性,进而探讨他们之间的亲缘关系。结果显示:(1)286对引物中筛选出60对条带清晰重复性高的多态性引物,多态性比例21.0%;其中Stowaway-like家族和Tourist-like家族特异引物的多态性比例分别为24.6%和20.0%。(2)PCR扩增结果显示,60对多态性引物对中国、加拿大、合成油菜品系的基因组DNA分别扩增出4 029、1 044、1 087条清晰可辨的条带。(3)UPGMA聚类显示,中国油菜品种间遗传相似系数在0.59~0.95,加拿大油菜品种间遗传相似系数在0.73~0.95;合成油菜品种间遗传相似系数值在0.64~0.93。研究表明,MITE在基因组中大量随机插入,形成种内丰富的多态性,利用MITE家族引物检测不同地区的油菜种质资源的多态性,可为油菜的育种找到许多尚未被开发的遗传变异。

主 题 词：微型反向重复转座因子(MITE) 甘蓝型油菜 遗传多样性 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 0713[0713] 

核心收录：

D　O　I：10.7606/j.issn.1000-4025.2019.08.1389

馆 藏 号：203779556...