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草鱼GSTR基因外显子1、外显子2的SNPs筛选及其与生长性状的关联分析

草鱼GSTR基因外显子1、外显子2的SNPs筛选及其与生长性状的关联分析

作     者:刘小献 白俊杰 徐磊 于凌云 樊佳佳 韩林强 LIU Xiao-xian;BAI Jun-jie;XU Lei;YU Ling-yun;FAN Jia-jia;HAN Lin-qiang

作者机构:中国水产科学研究院珠江水产研究所/中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室广州510380 大连海洋大学生命科学与技术学院大连116023 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 

基  金:现代农业产业技术体系建设专项(Nycytx-49-07) 

出 版 物:《华中农业大学学报》 (Journal of Huazhong Agricultural University)

年 卷 期:2011年第30卷第6期

页      码:753-758页

摘      要:根据草鱼EST数据库中的rho型谷胱甘肽硫转移酶基因cDNA序列设计引物,扩增预计存在的SNP位点。采用PCR产物测序法和PCR-RFLP法,在珠江水系草鱼养殖群体中筛选到2个SNP位点,分别位于外显子1和外显子2上,为C-T突变,且属于同义突变,统计了多态位点在群体中的分布:C+129T位点CC型占0.69%,TC型占8.75%,TT型占80.56%;C+192T位点CC型占25.4%,TC型占48.6%,TT型占26.1%。利用一般线性模型将SNPs与草鱼6个生长性状进行关联分析,结果表明,C+129T位点TT型个体6个生长性状均值比TC型高(P>0.05);C+192T位点TT型个体体质量均值高于TC型和CC型个体(P<0.05)。双倍型关联分析表明D1型个体的体质量均值明显高于D3型和D6型(P<0.05),因而可以考虑将GSTR基因作为影响草鱼体质量等生长性状的候选基因,应用于草鱼分子辅助育种。

主 题 词:草鱼 SNPs 谷胱甘肽硫转移酶 rho型谷胱甘肽硫转移酶基因 多态性 生长 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071002[071002] 

核心收录:

D O I:10.13300/j.cnki.hnlkxb.2011.06.022

馆 藏 号:203780354...

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