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正交设计优化柿属植物SSR-PCR反应体系

正交设计优化柿属植物SSR-PCR反应体系

作     者:梁玉琴 李芳东 傅建敏 乌云塔娜 吴硕 LIANG Yu-qin;LI Fang-dong;FU Jian-min;WU YUN Ta-na;WU Shuo

作者机构:中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 

基  金:林业公益性行业科研专项项目"柿属植物种质资源保护与选育技术研究"(200904041) 

出 版 物:《经济林研究》 (Non-wood Forest Research)

年 卷 期:2011年第29卷第4期

页      码:17-22页

摘      要:为了快速有效地确定柿属植物SSR-PCR反应体系,给柿属植物遗传多样性的SSR标记研究奠定基础,采用正交设计的方法,利用2×Taq PCR Master Mix,将Taq酶、dNTPs和Mg2+3个因素作为整体,综合评价其对柿属植物SSR-PCR反应体系的影响。结果显示:反应各因素水平对PCR反应均具有显著影响,其中Mix影响最大,引物次之,模板DNA最小;确定柿属植物SSR-PCR反应体系为模板DNA 2μL(40~100 ng)、2×TaqPCR Master Mix 10μL、引物1μL,总体积25μL;反应体系具有较高的重复性和稳定性,筛选出20对多态性较高的柿属植物SSR引物。

主 题 词:柿属植物 正交设计 SSR-PCR反应体系 2×Taq PCR Master Mix 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 090701[090701] 0907[农学-草药学] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

D O I:10.3969/j.issn.1003-8981.2011.04.004

馆 藏 号:203780662...

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