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基于atpF-atpH序列的稻属植物鉴定

基于atpF-atpH序列的稻属植物鉴定

作     者:许瑾 徐涛 宋云 李明福 张万霞 白松 杨碧 Xu Jin;Xu Tao;Song Yun;Li Mingfu;Zhang Wanxia;Bai Song;Yang Bi

作者机构:中国检验检疫科学研究院动植物检疫所北京100029 中国农业科学院作物科学研究所北京100081 云南出入境检验检疫局昆明650228 

基  金:质检公益性行业科研专项"防止水稻重要资源流失的DNA条形码技术研究"(10-45) 中国检科院基础科研业务费"几种云南珍稀植物种质资源的分子鉴定"(2009JK029) 

出 版 物:《中国农学通报》 (Chinese Agricultural Science Bulletin)

年 卷 期:2012年第28卷第24期

页      码:173-178页

摘      要:为从分子水平上鉴定稻属,对稻属9种32份植物材料DNA条形码基因atpF-atpH进行PCR扩增并对PCR扩增产物测序,以近缘种植物为外类群建立系统进化树及序列差异分析,设计了鉴定稻属的特异性引物。结果表明,atpF-atpH扩增产物为1条500bp左右的目标条带,对于供试的稻属材料,扩增效率和测序成功率均达到100%,应用该特异性引物对稻属材料进行扩增,均获得与预期大小一致的113bp特异性目的片段,而对非稻属材料的扩增结果均呈阴性。经序列差异分析,稻属植物在UPGMA聚类树上聚成一个单系类群,节点支持率为97%,显示atpF-atpH序列可用于稻属的分类鉴定。这说明在条码基因差异位点分析的基础上,设计特异分子标记可用于稻属的鉴定,为珍贵物种的口岸鉴定提供了检测方法。

主 题 词:atpF-atpH 稻属 DNA测序 分子鉴定 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 071001[071001] 07[理学] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D O I:10.3969/j.issn.1000-6850.2012.24.033

馆 藏 号:203780903...

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