siRNA序列特征的RNA干扰效率预测的新方法

作     者：徐宝林 于大川 高冬 张浩 刘元宁 XU Bao-lin;YU Da-chuan;GAO Dong;ZHANG Hao;LIU Yuan-ning

作者机构：吉林大学计算机科学与技术学院长春130012 吉林大学第一医院疼痛科长春130021 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(60971089) 

出 版 物：《吉林大学学报（信息科学版）》 (Journal of Jilin University（Information Science Edition）)

年 卷 期：2011年第29卷第5期

页      码：436-443页

摘      要：为了快速、准确预测siRNA(Small interfering Ribonucleic Acid)的干扰效率,通过对2 431条siRNA的统计学分析找到了一个可靠的预测新方法。通过统计学方法从众多特征中筛选出了19个与siRNA抑制效率相关的序列特征,并用这些特征给出了siRNA抑制效率水平的聚类方法,准确率达到81.1%。该方法将对高效的siRNA设计起到指导意义。

主 题 词：RNA干扰 干扰效率预测 序列特征 统计学分析 

学科分类：081203[081203] 08[工学] 0835[0835] 0812[工学-测绘类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1671-5896.2011.05.008

馆 藏 号：203786361...