日本蛇根草Oj3GT1基因的克隆与生物信息学分析

作     者：孙威 马玲 徐僡 申欢 鞠志刚 乙引 Sun Wei;Ma Ling;Xu Hui;Shen Huan;Ju Zhigang;Yi Yin

作者机构：贵州师范大学生命科学学院植物生理与发育调控重点实验室贵阳550025 贵阳中医学院药学院贵阳550025 贵州师范大学西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业局重点实验室贵阳550025 

基　　金：国家自然科学基金(31760076) 贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字 122) 贵州省重点实验室建设项目(黔科合计Z字 4005) 贵州省联合基金项目(黔科合LH字 7211号 7358号) 贵州省中医药管理局中医药和民族医药科学技术研究课题(S20160829000)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2019年第17卷第18期

页      码：5960-5965页

摘      要：类黄酮3-O-葡萄糖基转移酶(3GT)是花色苷合成途径中首个修饰酶,在花色苷合成与积累过程中起关键作用。本研究以日本蛇根草作为材料,依据其转录组信息设计Oj3GT1基因特异性引物,通过RT-PCR等分子生物学方法,分离并获得Oj3GT1基因的完整cDNA序列,并对Oj3GT1的信号肽、功能结构域、理化参数、亲/疏水性和二级结构等进行了生物信息学分析。根据分析结果可知,Oj3GT1基因的完整CDS长度为1 377 bp,蛋白分子量为50.922 kD,等电点为6.20,属于亲水性蛋白质,不含有信号肽。同时二级结构分析结果显示,Oj3GT1的蛋白二级结构主要是以不规则卷曲为主。综上所述,Oj3GT1基因的克隆与生物信息学分析,将为日本蛇根草花色苷的生物合成研究提供科学依据,同时也为通过基因工程方法调控和改变日本蛇根草花色苷的合成提供理论支撑。

主 题 词：日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica) Oj3GT1 基因克隆 生物信息学分析 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.017.005960

馆 藏 号：203792036...