一种面向基因与疾病关系的文本挖掘方法

作     者：龚乐君 韦有兵 谢建明 袁志栋 孙啸 Gong Lejun;Wei Youbing;Xie Jianming;Yuan Zhidong;Sun Xiao

作者机构：东南大学生物电子学国家重点实验室南京210096 淮阴工学院计算机工程学院淮安223003 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(60771024) 

出 版 物：《东南大学学报（自然科学版）》 (Journal of Southeast University：Natural Science Edition)

年 卷 期：2010年第40卷第3期

页      码：486-490页

摘      要：结合模式匹配、生物医学本体及共现技术,设计了一种自动抽取基因与疾病、基因与基因之间关系的文本挖掘方法,并开发了一个可以处理海量文本数据的系统.该系统可抽取与疾病相关的基因实体,挖掘基因与疾病、基因与基因之间的关系,衡量基因与疾病实体的相关性,并为分析基因与疾病、基因与基因之间的关系提供了网络可视化工具.实验结果表明,系统在测试数据集上抽取基因与疾病之间的关系可获得83.0%的综合测评率,抽取基因与基因之间的关系可获得78.5%的综合测评率.该系统已成功应用于乳腺癌及相关基因的研究.

主 题 词：生物医学 文本挖掘 关系抽取 实体识别 

学科分类：0810[工学-土木类] 081203[081203] 08[工学] 0805[工学-能源动力学] 0835[0835] 0812[工学-测绘类] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1001-0505.2010.03.010

馆 藏 号：203795340...