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基于茶树SNP的dCAPS标记体系研究

基于茶树SNP的dCAPS标记体系研究

作     者:张成才 王丽鸳 韦康 成浩 包云秀 刘本英 汪云刚 ZHANG Cheng-cai;WANG Li-yuan;WEI Kang;CHENG Hao;BAO Yun-xiu;LIU Ben-ying;WANG Yun-gang

作者机构:中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心浙江杭州310008 云南省农业科学院茶叶研究所云南勐海666201 

基  金:现代农业产业技术体系建设专项资金(No.nycytx-23) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2012Z L049) 浙江省自然科学基金(X307603) 浙江省茶产业技术创新战略联盟专项资金 

出 版 物:《茶叶科学》 (Journal of Tea Science)

年 卷 期:2012年第32卷第6期

页      码:517-522页

摘      要:从茶树EST序列中搜寻出候选SNPs位点,在候选SNPs两侧设计测序引物进行PCR扩增,并对扩增产物双向测序验证;然后从每个扩增子中选择一个确证的SNPs,设计dCAPS引物,并进行扩增和酶切验证,将SNPs转化为dCAPS标记;最后,在长叶白毫×福鼎大白的F1群体中检测了标记的分离情况。结果发现,20对测序引物中有11对扩增成功,共确证了17个SNPs,占检测总数的54.8%;在设计的11对dCAPS引物中,有8对在长叶白毫、福鼎大白和龙井43等8个品种中表现出多态性,成功转化为dCAPS标记,转化成功率72.7%;8个dCAPS标记中的DCC229和DCC371在长叶白毫和福鼎大白之间表现有多态性,经检测,它们在这2个品种的F1群体中均符合孟德尔1︰1分离。

主 题 词:茶树 EST SNP dCAPS 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 09[农学] 090203[090203] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 

D O I:10.13305/j.cnki.jts.2012.06.013

馆 藏 号:203796360...

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