亚硫酸氢钠测序法检测水稻FIE基因CpG岛甲基化状态

作     者：汪艳杰 龙鸿 姚家玲 WANG Yan-Jie;LONG Hong;YAO Jia-Ling

作者机构：华中农业大学生命科学技术学院武汉430070 

基　　金：国家重点基础研究发展计划(973计划:2007CB108704) 国家自然科学基金项目(30971551) 

出 版 物：《植物科学学报》 (Plant Science Journal)

年 卷 期：2011年第29卷第1期

页      码：134-139页

摘      要：建立了适用于水稻基因组特定基因甲基化检测的亚硫酸氢钠测序法,并利用此方法对FIE2A基因CpG岛部分片段的甲基化差异进行了研究。采用CTAB法提取水稻叶片和胚乳细胞的基因组DNA,经亚硫酸氢钠化学修饰后,针对已修饰的FIE基因序列设计特异引物并结合巢式PCR扩增,TA载体克隆、测序,最后对测序结果进行分析。结果表明巢式PCR能够增加特异性产物的产生,FIE基因CpG岛在对称的CG和CNG位点甲基化水平较高,而在非对称CNN位点甲基化水平最低,此外在叶片中的平均甲基化水平较高。由此表明本研究建立的亚硫酸氢钠测序法适用于水稻基因组特定基因甲基化状态的检测。

主 题 词：亚硫酸氢钠测序法 DNA甲基化 水稻 FIE基因 CpG岛 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/SP.J.1142.2011.10134

馆 藏 号：203803755...