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寨卡病毒SYBR Green qPCR检测方法的建立

寨卡病毒SYBR Green qPCR检测方法的建立

作     者:陈国强 李永旺 王凯民 唐泰山 姜焱 朱婷 陆春华 时长军 CHEN Guo-qiang;LI Yong-wang;WANG Kai-min;TANG Tai-shan;JIANG Yan;ZHU Ting;LU Chun-hua;SHI Chang-jun

作者机构:苏州海关江苏苏州215021 苏州西山生物技术有限公司 南京海关 

基  金:南京海关科研项目(2018KJ14) 

出 版 物:《中国国境卫生检疫杂志》 (Chinese Journal of Frontier Health and Quarantine)

年 卷 期:2019年第42卷第5期

页      码:309-311,316页

摘      要:目的建立寨卡病毒的实时定量PCR(qPCR)检测方法。方法比较公布的寨卡病毒核酸序列,在保守区域NS5设计引物,用重组质粒建立标准曲线分析建立的qPCR方法的扩增效率和线性范围,用6个寨卡病毒分离株及登革病毒、基孔肯雅病毒、黄热病毒、乙脑病毒等其他黄病毒核酸进行灵敏性和特异性分析,并与3对已公布的寨卡病毒引物进行比较。结果针对寨卡病毒NS5基因设计了1对引物并建立了SYBR Green q PCR方法,以重组质粒为模板的扩增效率为89.3%,在2.0×10^1~2.0×10^8拷贝/μl范围内线性关系良好,最低可检测到100拷贝/反应。以ZIKV GD01株核酸为模板时,该方法可稳定检测到3.48×10^-4ng/μl RNA,与两对已公布的引物敏感性相同,比另1对引物敏感性高10倍。5个模板浓度梯度各3次重复检测的变异系数为0.06%~0.62%。该方法可以检出6株非洲型和亚洲型寨卡病毒,且与其他4种黄病毒无交叉反应。结论建立了寨卡病毒SYBR Green qPCR检测方法。该方法灵敏性高、特异性强、重复性好,为口岸提供了技术手段和技术支撑。

主 题 词:寨卡病毒 实时定量PCR 染料法 非结构蛋白 

学科分类:1004[医学-公共卫生预防医学类] 100401[100401] 10[医学] 

D O I:10.16408/j.1004-9770.2019.05.002

馆 藏 号:203807765...

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