条斑紫菜SAMS基因克隆与生物信息学分析

作     者：易乐飞 王萍 周向红 刘楚吾 YI Le-fei;WANG Ping;ZHOU Xiang-hong;LIU Chu-wu

作者机构：淮海工学院江苏省海洋生物技术重点实验室连云港222005 广东海洋大学水产学院湛江524088 

基　　金：国家科技支撑计划(2007BAD29B03) 江苏省海洋生物技术重点实验室开放课题(2008HS004)资助项目 

出 版 物：《中国生物工程杂志》 (China Biotechnology)

年 卷 期：2009年第29卷第7期

页      码：43-49页

摘      要：干旱、高盐和低温是限制植物生长和农作物产量的主要逆境因子。S-腺苷甲硫氨酸合成酶(S-adenosylmethionine synthetase,SAMS)与植物抗逆境密切相关,而且超表达SAMS的转基因植物具有更高的抗干旱、高盐和低温能力。进行条斑紫菜(Porphyra yezoensis)S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(PySAMS)cDNA的克隆及序列特征分析。首先利用电子克隆技术得到基因相关的contig,预测全长并设计引物,最后利用RT-PCR技术成功克隆了PySAMS的cDNA序列(GenBank accession:FJ404748)。该cDNA序列含有长1155nt的完整ORF,编码蛋白(PySAMS)分子量41.8kDa,长384AA。PySAMS与盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)、莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)等多种生物的SAMS具有较高的序列一致性,含有与SAMS酶活性密切相关的氨基酸残基和保守序列,与人(Homo sapiens)和大肠杆菌(Escherichia coli)的SAMS具有高度相似的三维结构。所以PySAMS与其它生物的SAMS一样,在条斑紫菜的抗逆过程中发挥重要作用。研究PySAMS有助于阐明条斑紫菜耐受非生物胁迫的作用机理,有助于获得高抗逆转基因植物。

主 题 词：条斑紫菜 S-腺苷甲硫氨酸合成酶 克隆 生物信息学 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.13523/j.cb.20090709

馆 藏 号：203810121...