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金黄色葡萄球菌REP-PCR指纹图谱分型方法优化

金黄色葡萄球菌REP-PCR指纹图谱分型方法优化

作     者:汪川 余倩 康睿 张朝武 裴晓方 刘衡川 

作者机构:四川大学华西公共卫生学院医检教研室成都610041 

基  金:四川大学华西公共卫生学院青年科学研究基金 

出 版 物:《中国公共卫生》 (Chinese Journal of Public Health)

年 卷 期:2009年第25卷第11期

页      码:1354-1356页

摘      要:目的优化金黄色葡萄球菌细菌基因组重复序列PCR(REP-PCR)指纹图谱分型方法,并在临床分离株分型研究中应用,为构建金黄色葡萄球菌同源性追踪体系提供依据。方法试剂盒法提取金黄色葡萄球菌标准菌株ATCC 25923基因组DNA作为模板,根据参考文献设计REP引物,PCR扩增其基因组中靶序列。优化反应体系Mg2+浓度、模板量、引物浓度和退火温度,以得到最佳指纹图谱。以优化好的REP-PCR方法对10株金黄色葡萄球菌临床分离株进行分型。结果PCR反应体系Mg2+浓度2.5 mmol/L,DNA模板量125 ng/25μL,引物REP1R、REP2浓度各0.6μmol/L,退火温度40℃时,指纹图谱条带最清晰、明亮;10株临床分离株指纹图谱均在0.5~1.0 kb之间出现1条相同条带,其中1~3,4,5,8,9号菌株图谱相同;7和10号菌株除在0.5~1.0 kb出现1条条带外,还在1.0~1.5 kb出现1条条带,在1.5~2.0 kb出现1条条带;6号菌株共产生5条条带,分别出现在0.5~1.0 kb(2条),1.0~1.5 kb(2条)和1.5~2.0 kb(1条)。结论成功建立优化的金黄色葡萄球菌REP-PCR指纹图谱分型方法;10株临床分离株用该法分为3型。

主 题 词:金黄色葡萄球菌 REP-PCR 条件优化 指纹图谱分型 

学科分类:12[管理学] 1204[管理学-公共管理类] 120402[120402] 1004[医学-公共卫生预防医学类] 10[医学] 

馆 藏 号:203810232...

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