基于MPI和CUDA的蛋白质定量软件的设计和分析

作     者：詹科 王靖 袁良 张云泉 ZHAN Ke;WANG Jing;YUAN Liang;ZHANG Yun-quan

作者机构：中国科学院软件研究所并行软件与计算科学实验室北京100190 中国科学院研究生院北京100049 

基　　金：中国科学院知识创新工程重大项目课题(KGCX1-YW-13)资助 

出 版 物：《计算机科学》 (Computer Science)

年 卷 期：2013年第40卷第3期

页      码：36-37,54页

摘      要：介绍了蛋白质定量软件的设计及测试结果,分析结果表明:P-QuantWiz软件在曙光6000的Intel集群部分,测试规模达到2048核,在256核加速比仍在增加。相对P-QuantWiz软件在单CPU运行的结果,PG-QuantWiz软件在单GPU运行的加速比为8.1,在16个GPU上运行的加速比为14.18,并行效率为89%。

主 题 词：MPI CUDA 蛋白质定量 

学科分类：08[工学] 081202[081202] 0812[工学-测绘类] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1002-137X.2013.03.006

馆 藏 号：203811776...