甜菜基因组SSR标记特征分析

作     者：刘蕊 董玉飞 刘乃新 吴玉梅 LIU Rui;DONG Yu-fei;LIU Nai-xin;WU Yu-mei

作者机构：黑龙江大学农作物研究院哈尔滨150080 东北林业大学园林学院哈尔滨150080 青海大学农牧学院/青海省农林科学院土壤肥料研究所西宁810016 黑龙江大学生命学院哈尔滨150080 

基　　金：国家现代农业产业技术体系(糖料)建设专项“质量安全与营养品质评价”(CARS-17-0503) 国家农产品质量安全风险评估专项经费“枸杞参茸百合糖料等食用特色农产品质量分析评价与关键控制点研究"(GJFP2018010002) 国家科技基础条件平台项目“国家甜菜种质资源平台”(NICGR20I9-17) 

出 版 物：《中国甜菜糖业》 (China Beet & Sugar)

年 卷 期：2019年第3期

页      码：5-11页

摘      要：简单序列重复(SSR)标记在甜菜遗传和应用研究中得到了广泛的应用,但在甜菜中应用有限。甜菜是世界上重要的糖料作物之一,因此需要开发更多的SSR标记。本研究对甜菜全基因组中简单重复简单重复序列(SSR)进行了鉴定。甜菜基因组共有174218个SSR位点,平均分布频率为463/MB。在甜菜的SSR序列中,五核昔酸(33. 32%)>三核昔酸(31.80%)>二核昔酸(20. 37%)>六核昔酸(12.51%)>四核昔酸(2. 00%).在所设计的27649对引物中,18274对可以特异性扩增,是SSR标记物的37倍。甜菜中含有SSR的蛋白质编码基因与细胞过程、代谢过程、刺激反应和生物调控有关。我们的研究结果将为进一步开发新的SSR标记提供依据,这些标记在甜菜遗传研究的许多方面具有重要价值。

主 题 词：甜菜 基因组SSR GO分析 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1002-0551.2019.03.002

馆 藏 号：203817324...