使用遗传算法优化登革热病毒信封蛋白的肽抑制剂

作     者：贺子豪 赵俊强 杨敏 张松杰 徐永涛 He Zihao;Zhao Junqiang;Yang Min;Zhang Songjie;Xu Yongtao

作者机构：新乡医学院生物医学工程学院河南新乡453000 新乡医学院三全学院河南新乡453000 新乡市生物医学信息研究重点实验室河南新乡453000 临床与生物医学大数据融合技术河南省工程实验室河南新乡453000 新乡市智能医学虚拟重点实验室河南新乡453000 

基　　金：国家自然科学基金(201603180) 中国国家留学基金委(201708410492) 新乡医学院科研启动经费(505060 505144) 新乡医学院生物医学工程学院开放课题(2018-BME-KFKT-01 2018-BME-KFKT-10 2018-BME-KFKT-11) 河南省高等学校青年骨干教师培养计划(2017GGJS219) 

出 版 物：《河南师范大学学报（自然科学版）》 (Journal of Henan Normal University(Natural Science Edition))

年 卷 期：2019年第47卷第6期

页      码：38-44页

摘      要：登革热病毒严重威胁了人类的健康.目前仍无有效的治疗措施.膜融合是登革热病毒入侵细胞的第一步.信封蛋白的构象变化在膜融合过程中起到关键作用.研发针对信封蛋白的肽抑制剂为治疗登革热提供了潜在的重要靶点.设计了优化针对信封蛋白的肽抑制剂的遗传算法,分别使用3种不同的选择算子(轮盘法、锦标赛法和并行法),对初始父代进行300代的优化.通过比较发现并行法的结果较好,命名最优的结果为DN58ga.与此同时还获得了一些多肽衍生物.通过计算验证,这些多肽比父代表现出与登革热病毒信封蛋白更好的结合能力.这些新的肽抑制剂有可能打断融合过程中的蛋白-蛋白相互作用,并有望作为开发登革热病毒信封蛋白新型抑制剂的起点.

主 题 词：登革热病毒 膜融合 信封蛋白 肽抑制剂 遗传算法 

学科分类：0831[工学-公安技术类] 08[工学] 0836[0836] 

D　O　I：10.16366/j.cnki.1000-2367.2019.06.006

馆 藏 号：203820590...