多重PCR引物在Xp11.2易位/TFE3基因融合中的应用

作     者：叶胜兵 李锐 夏秋媛 王小桐 王璇 章如松 时姗姗 马恒辉 陆珍凤 饶秋 Ye Shengbing;Li Rui;Xia Qiuyuan;Wang Xiaotong;Wang Xuan;Zhang Rusong;Shi Shanshan;Ma Henghui;Lu Zhenfeng;Rao Qiu

作者机构：解放军东部战区总医院(原南京军区南京总医院)病理科南京210002 

基　　金：国家自然科学基金面上项目(81872095) 

出 版 物：《中华病理学杂志》 (Chinese Journal of Pathology)

年 卷 期：2019年第48卷第12期

页      码：970-973页

摘      要：目的 对Xp11.2易位/TFE3基因不同融合类型设计多重PCR引物,证实多重PCR联合Sanger法测序的可行性,旨在探讨引物设计的重要性.方法 选取已通过高通量RNA-Seq测序证实TFE3融合类型的标本23例,其融合类型包括PSF-TFE3 3种,PRCC-TFE3 3种,ASPL-TFE3 2种, FUBP1-TFE3 1种,NONO-TFE3 2种,RBM10-TFE3 1种,MED15-TFE3 1种以及MATR3-TFE3 1种共计14种,对其用设计好的多重PCR引物进行PCR扩增并联合Sanger法测序进行验证,该次实验分4个多重PCR反应,包括14条不同基因的正向引物以及4条TFE3反向引物.结果 23例标本均与高通量RNA-Seq测序结果完全一致,可见所设计的引物通过多重PCR联合Sanger法测序是可行的.结论该方法的优势在于利用4个多重PCR反应便可确定是否存在上述14种TFE3融合类型阳性,并通过反向测序便可确定具体融合类型.因此从试剂成本方面考虑,尤其在大批量标本的TFE3融合类型筛查过程中,该方法较高通量RNA-Seq测序有很大的优势.

主 题 词：多重PCR 反向引物 引物设计 PCR引物 正向引物 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.0529-5807.2019.12.012

馆 藏 号：203823974...