嗜水气单胞菌分离株ERIC-PCR及RAPD分型比较

作     者：罗志飞 胡萌 陆承平 刘永杰 LUO Zhi-fei;HU Meng;LU Cheng-ping;LIU Yong-jie

作者机构：南京农业大学动物医学院江苏南京210095 

基　　金：教育部"新世纪优秀人才支持计划"基金资助项目(NCET-07-0440) 公益性行业(农业)科研专项(200803013) 

出 版 物：《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期：2011年第31卷第4期

页      码：504-508页

摘      要：采用ERIC-PCR和RAPD 2种方法对嗜水气单胞菌2009年分离菌株及实验室保存菌株共83株进行分子分型。参考相关文献设计并合成引物,分别进行PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳,电泳结果经Quantity One软件数值化后利用SPSS软件进行聚类分析。结果显示,除少数分离株外,使用2种方法对大多数菌株分型,均能得到多态性较好的指纹图谱。RAPD的AP12H引物能扩增出1～12个200～4 500bp之间的条带,可将嗜水气单胞菌分离株分为4群、12类。ERIC-PCR能扩增出4～16个100～5 800bp之间的条带,将嗜水气单胞菌分离株分为4群、17类,同一年代、同一地域分离株分别有聚成一类的趋势。2种分型方法均体现很好的分型能力。但ERIC-PCR分型与RAPD分型相比,重复性和稳定性更好,分辨力更高,且具备RAPD不要求模板序列已知而直接进行扩增的优点,更适合嗜水气单胞菌的分型研究。

主 题 词：嗜水气单胞菌 分型 ERIC-PCR RAPD 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录：

D　O　I：10.16303/j.cnki.1005-4545.2011.04.036

馆 藏 号：203826206...