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基于转录组测序筛选维生素D调节肉鸡十二指肠钙和磷吸收的差异表达基因

基于转录组测序筛选维生素D调节肉鸡十二指肠钙和磷吸收的差异表达基因

作     者:杨雪 汪晓娜 张宁 瞿红侠 施传信 张进良 闫永峰 郑永祥 王志祥 韩进诚 YANG Xue;WANG Xiaona;ZHANG Ning;QU Hongxia;SHI Chuanxin;ZHANG Jinliang;YAN Yongfeng;ZHENG Yongxiang;WANG Zhixiang;HAN Jincheng

作者机构:河南农业大学牧医工程学院郑州450046 商丘师范学院生物与食品学院动物科学系商丘476000 宜兰大学生物技术与动物科学系中国台湾宜兰26047 

基  金:国家自然科学基金项目(U1704107) 

出 版 物:《动物营养学报》 (CHINESE JOURNAL OF ANIMAL NUTRITION)

年 卷 期:2019年第31卷第11期

页      码:5202-5213页

摘      要:本试验利用转录组测序技术(RNA-seq)筛选维生素D调节肉鸡十二指肠钙和磷吸收的功能基因和信号通路。以1~16日龄罗斯308肉鸡为试验动物,设计3种饲粮,分别在基础饲粮(不含维生素D)中添加0(对照)、5、10μg/kg 1,25-二羟基维生素D 3[1,25-(OH)2-D 3]。16日龄时屠宰肉鸡,刮取十二指肠黏膜,利用转录组测序技术,对差异表达基因进行GO(gene ontology)功能注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)信号通路富集。结果表明:1)与对照组相比,添加5和10μg/kg 1,25-(OH)2-D 3显著改善肉鸡生长性能(P<0.05),增强股骨和胫骨矿化;但10μg/kg 1,25-(OH)2-D 3组肉鸡胫骨与股骨的重量、长度和灰分重量显著低于5μg/kg 1,25-(OH)2-D 3组(P<0.05)。2)分别进行0 vs.5μg/kg、0 vs.10μg/kg、5 vs.10μg/kg 1,25-(OH)2-D 3组间的比较,在各组间筛选出1029、939和642个差异表达基因。3)经GO功能注释,筛选出细胞膜维生素D受体(PDIA3)、细胞核维生素D受体(VDR)、Ⅱb型钠磷转运载体蛋白(SLC34A2)、无机磷转运载体蛋白2(SLC20A2)、钙结合蛋白D28k(CALB1)、钙离子转运ATP酶B1(ATP2B1)、钙离子转运ATP酶B2(ATP2B2)、钠钙交换蛋白(SLC8A1)、成纤维细胞生长因子1(FGF1)和成纤维细胞生长因子19(FGF19)等差异表达基因,这些基因富集到十二指肠中调节钙和磷吸收代谢的过程。4)KEGG通路富集结果显示,差异表达基因富集到丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路或环磷酸腺苷-蛋白激酶A(cAMP-PKA)信号传导通路和环磷酸鸟苷-蛋白激酶G(cGMP-PKG)信号通路。5)选出4个差异表达基因进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测,结果显示qRT-PCR与转录组测序结果基本一致。综上,本试验筛选出维生素D调节肉鸡十二指肠钙和磷吸收的关键基因和信号通路,为改善肉鸡钙和磷利用率奠定理论基础。

主 题 词:肉鸡 十二指肠 钙磷代谢 差异表达基因 信号通路 

学科分类:0905[农学-林学类] 09[农学] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1006-267x.2019.11.036

馆 藏 号:203829785...

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