光棘球海胆的主要卵黄蛋白cDNA序列分析

作     者：周遵春 包振民 董颖 赫崇波 韩家波 王丽梅 ZHOU Zun-chun;BAO Zhen-min;DONG Ying;HE Chong-bo;HAN Jia-bo;WANG Li-mei

作者机构：中国海洋大学生命科学与技术学部山东青岛266003 辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室辽宁省应用海洋生物技术开放实验室辽宁大连116023 

基　　金：辽宁省自然科学基金项目资助(20042127) 

出 版 物：《中国水产科学》 (Journal of Fishery Sciences of China)

年 卷 期：2006年第13卷第3期

页      码：352-359页

摘      要：提取成熟光棘球海胆(Strongylocentrotus nudus)性腺中的RNA做模板,根据NCBI数据库中已知海胆(编号:AB097218、AB192414、AY090112)主要卵黄蛋白MYP cDNA保守序列设计引物,用LA PCR方式分段扩增并测序得到了光棘球海胆MYP cDNA的全序列。扩增的cDNA全长4 061 bp,包含4 047 bp的开放阅读框,共编码1 349个氨基酸。用CluxtalX1.83对光棘球海胆与其他几种已知海胆MYP cDNA及推导的氨基酸序列进行比对,用Mega3.01计算遗传距离及构建进化树,结果表明,光棘球海胆与其他7种海胆的MYP具有高度的同源性。从氨基酸水平上看,光棘球海胆与红海胆(Pseudocentrotus depressus)亲缘关系最近,遗传距离为0.069±0.01;与同科的马粪海胆(Hemicentrotus pulcher-rimus)、紫球海胆(***)、中间球海胆(***)的遗传距离分别是0.095±0.012、0.098±0.011和0.101±0.012;与白棘三列海胆(Tripneustes gratilla)、拟球海胆(Paracentrotus lividus)及绿海胆(Lytechinus variega-tus)亲缘关系相对较远,遗传距离分别是0.216±0.017、0.218±0.017和0.535±0.028。获得光棘球海胆MYP

主 题 词：光棘球海胆 主要卵黄蛋白cDNA 序列分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:1005-8737.2006.03.003

馆 藏 号：203839814...