大蒜SSR体系的建立与优化

作     者：周静 陈书霞 程智慧 孟焕文 ZHOU Jing;CHEN Shuxia;CHENG Zhihui;MENG Huanwen

作者机构：西北农林科技大学园艺学院陕西杨凌712100 

基　　金：唐仲英西北农林科技大学育种基金 西北农林科技大学青年学术骨干支持计划(01140303) 

出 版 物：《西北农业学报》 (Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica)

年 卷 期：2011年第20卷第11期

页      码：117-122页

摘      要：为建立适宜大蒜（Allium sativum L.）的SSR反应体系和扩增程序,应用L16（45）正交设计对影响SSR-PCR的主要参数进行优化。结果表明,适宜大蒜的SSR反应体系总体积为20μL,其中含TaqDNA聚合酶0.02 U/μL、引物为0.2μmol/L、Mg2＋2.0 mmol/L、dNTP 0.2 mmol/L、DNA 30 mg/L;PCR适宜扩增程序为：94℃预变性3 min,94℃变性30 s,55℃45 s,72℃延伸90 s,35次循环,94℃变性30 s,53℃45 s,72℃延伸1 min,10次循环的最后一个循环延伸增加为10 min。并优化引物最适合退火温度为53.5~58.5℃。利用此反应体系对40份大蒜品种进行SSR扩增并电泳检测,扩增谱带清晰且多态性较好,证明此体系稳定可靠。在此基础上,利用优化的SSR反应体系对100对大葱SSR引物进行筛选,从中筛选出1对扩增谱带清晰稳定性好的SSR引物,并对40份大蒜品种进行遗传多样性分析。这一对SSR引物共检测出3个多态性条带可将供试材料聚为2大类,大部分品种（系）都按照其地理来源和遗传背景进行聚类。

主 题 词：大蒜 SSR PCR 体系优化 遗传多样性 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090202[090202] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1004-1389.2011.11.023

馆 藏 号：203842204...