靶向膜型1基质金属蛋白酶反义肽的虚拟筛选与分子模拟

作     者：曾丽 谭博文 杨亚蓝 邱槿怡 熊莉丽 茆灿泉 Li Zeng;Bowen Tan;Yalan Yang;Jinyi Qiu;Lili Xiong;Canquan Mao

作者机构：西南交通大学生命科学与工程学院分子进化与应用生物学实验室四川成都610031 

基　　金：中央高校基本科研业务费专题研究项目(No.SWJTU09ZT28) 国家高技术研究发展计划(863计划)(No.2006AA06Z353)资助~~ 

出 版 物：《生物工程学报》 (Chinese Journal of Biotechnology)

年 卷 期：2015年第31卷第2期

页      码：269-280页

摘      要：膜型1基质金属蛋白酶(Membrane type-1 matrix metalloproteinase,MT1-MMP,MMP14)在肿瘤的发生发展及转移中起着重要作用,是肿瘤潜在理想的药物靶标。为了获得MT1-MMP结合肽,我们首先采用生物信息学方法分析MMPs序列,获得MT1-MMP差异大且特异的序列。以此为正义肽靶标,设计反义肽库,然后通过分子对接、分子动力学模拟以及体外细胞实验等多种方法,进行靶向MT1-MMP反义肽的筛选与活性研究。多序列比对确定了位于MT1-MMP环区的特异序列AYIREGHE(简称MT1-loop),并构建1 536条反义肽。经两轮虚拟筛选,选取打分位于前五的反义肽用于后续研究。该五条反义肽与MT1-MMP存在较强的相互作用且能很好地对接于正义肽区域。进一步分析其与MMPs其他家族成员(MMP1-3,MMP7-13,MMP14HPX,MMP16)的亲和力,发现反义肽FVTFPYIR对MT1-MMP具有更强的特异性。分子动力学模拟表明,反义肽FVTFPYIR可能是通过影响受体MT1-MMP的构象稳定性,进而影响其功能活性。体外细胞实验初步确定反义肽FVTFPYIR可选择性地抑制表达MT1-MMP的人成骨肉瘤细胞MG63和乳腺癌MDA-MB-231细胞的增殖。本研究为抗肿瘤反义肽先导药物的研发提供了一种新的思路与途径。

主 题 词：膜型1基质金属蛋白酶(MT1-MMP,MMP14) 反义肽 分子对接 分子动力学模拟 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 071010[071010] 081704[081704] 1001[医学-基础医学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0836[0836] 

核心收录：

D　O　I：10.13345/j.cjb.140199

馆 藏 号：203849638...