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鸡传染性支气管炎病毒W株膜蛋白基因的分子特征

鸡传染性支气管炎病毒W株膜蛋白基因的分子特征

作     者:贺秀媛 张淑霞 张君涛 陈红英 王川庆 崔保安 王建华 HE Xiu-yuan;ZHANG Shu-xia;ZHANG Jun-tao;CHEN Hong-ying;WANG Chuan-qing;CUI Bao-an;WANG Jian-hua

作者机构:河南农业大学牧医工程学院河南郑州450002 西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100 

基  金:河南省科技攻关项目(0424050015) 陕西省自然科学基金项目(SJ08C110) 

出 版 物:《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 (Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition))

年 卷 期:2009年第37卷第9期

页      码:27-33页

摘      要:【目的】研究鸡传染性支气管炎病毒(IBV)W侏膜蛋白基因的分子特征。【方法】根据GenBank中已发表的鸡传染性支气管炎病毒M基因序列,设计并合成1对特异性引物,利用RT-PCR技术成功扩增了IBV河南地方分离毒株W株M基因全长片段,然后进行克隆、测序,并与GenBank中发表的11株国内外参考毒株进行比较分析。【结果】获得的W株M基因全长为681bp,编码M蛋白226个氨基酸残基,其N端的前60nt为前导序列,近N端含有2个潜在的N-糖基化位点;3个跨膜区域分别位于21-37,45~68,74~94aa处,在171~176,183~193aa处有2个潜在的抗原位点,且M蛋白上有9个高度保守的半胱氨酸;与参考毒株相比,IBV-W株M基因的核苷酸同源性为88.2%~92.7%,推导的氨基酸同源性为91.1%~95.67%;M蛋白的突变主要发生在前16位氨基酸,其中第2位缺失1个氨基酸,第3~6位连续插入4个氨基酸,第8~9位缺失2个氨基酸,第14~16位的3个氨基酸发生连续突变,其他位点的氨基酸变异为点突变,M蛋白核苷酸序列的变异主要表现为静默突变,亲水区较疏水区更易变易;在系统发生进化树中,W株与BJ株处于同一个小的分支上,亲缘关系较近,而与其他参考株的亲缘关系较远。【结论】推测W株可能是一个新的变异株。

主 题 词:鸡传染性支气管炎病毒(IBV) M基因 分子特征 

学科分类:090603[090603] 0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0906[农学-水产类] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.13207/j.cnki.jnwafu.2009.09.037

馆 藏 号:203850035...

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