杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

作     者：彭沙沙 童再康 黄华宏 周厚君 时剑 林二培 PENG Sha-sha;TONG Zai-kang;HUANG Hua-hong;ZHOU Hou-jun;SHI Jian;LIN Er-pei

作者机构：浙江农林大学林业与生物技术学院浙江临安311300 

基　　金：浙江省重大科技专项(2008C02004-1) 浙江省自然科学基金资助项目(Y3090510) 浙江省林业厅资助项目(08A10) 

出 版 物：《浙江农林大学学报》 (Journal of Zhejiang A&F University)

年 卷 期：2012年第29卷第1期

页      码：1-6页

摘      要：纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列。应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因。多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71%以上。利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础。

主 题 词：林木育种学 杉木 纤维素合成酶类似蛋白 克隆 表达 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 090701[090701] 0907[农学-草药学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.2095-0756.2012.01.001

馆 藏 号：203866066...