基于qPCR和LAMP技术的马铃薯晚疫病菌快速检测方法

作     者：祝菊澧 梁静思 张佩 王伟伟 林桐司骐 谢欣娱 苏瑞 唐唯 Zhu Juli;Liang Jingsi;Zhang Pei;Wang Weiwei;Lin Tongsiqi;Xie Xinyu;Su Rui;Tang Wei

作者机构：云南师范大学生命科学学院云南昆明650500 云南师范大学马铃薯科学研究院云南昆明650500 云南省马铃薯生物学重点实验室云南昆明650500 

基　　金：国家自然科学基金(31660503) 云南师范大学2019年度研究生科研创新基金(ysdy js2019132) 

出 版 物：《作物杂志》 (Crops)

年 卷 期：2019年第6期

页      码：168-176页

摘      要：马铃薯晚疫病菌(Phytophthora inibstans)能侵染多种茄科植物,它引起的马铃薯晚疫病,是马铃薯生产中创第一大病害。为了开发能在田间快速检测马铃薯晚疫病病原的方法,利用*** T30-4基因组测序数据的contig 1.18131,设计qPCR和LAMP引物,优化扩增条件后得到引物的特异性和灵敏度,最后通过检测田间收获薯块,比较形态学传统方法、qPCR及LAMP的差异。特异性检测结果发现,qPCR和LAMP仅在含有*** DNA模板鸽体系有阳性扩增,在寄主和其他微生物DNA中均无扩增;在优化的条件下,qPCR和LAMP的检测下限可达1×lO^6ng/μL,在有寄主和其他微生物DNA存在的条件下,引物的灵敏度没有显著差异。利用两种快速方法对在大理、丽江及昆明3个地区田间收获薯块上检测发现,qPCR和LAMP方法得到的检出率差异极为不显著(P=0.420),两种快速检测方法和形态学鉴定方法检出率差异极显著(P=0.009)□在大理、丽江及昆明3个地区的薯块中,两种分子检测方法检出率均比形态学方法高。其中,qPCR检测方法比形态学方法分别提高了12.00%、2.00%、8.70%;LAMP检测方法比形态学方法分别提高了11.30%,2.00%、8.70%。

主 题 词：定量PCR(qPCR) 环介导等温扩增(LAMP) 马铃薯晚疫病菌 潜伏侵染 检测 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 

D　O　I：10.16035/j.issn.1001-7283.2019.06.027

馆 藏 号：203870723...