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刺槐Na^+/H^+逆向转运蛋白RpNHX1基因的分离和生物信息学分析(英文)

刺槐Na^+/H^+逆向转运蛋白RpNHX1基因的分离和生物信息学分析(英文)

作     者:于学宁 刘欣玲 董秀春 樊金会 曹帮华 Yu Xuening;Liu Xinling;Dong Xiuchun;Fan Jinhui;Cao Banghua

作者机构:山东农业大学林学院泰安271018 山东艺术学院校园管理中心济南250307 

基  金:Fundation Program:This research was supported by the Ministry of Science and Technology of China(02EFN216700794) Shandong Agricultural Strain Improvement Engineering Program (Shandong Agri.Sci.2006-90) 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2007年第5卷第6期

页      码:775-784页

摘      要:盐分胁迫严重影响植物生长和产量。为了研究木本植物对盐分的适应性,利用5 RACE技术,从刺槐中克隆得到液泡Na^+/H^+逆向转运蛋白基因RpNHX1。该基因长度为2281 bp,含有一个开放阅读框,编码535氨基酸残基组成的蛋白,该蛋白序列与大豆GmNHX1和拟南芥AtNHX1相似,氨基酸的同源性分别达85%和69%,RpNHX1属于NHX亚族的NHX-I分枝。用生物信息学的方法预测RpNHX1具有所有Na^+/H^+逆向转运蛋白共同的结构特点,即含有疏水的N末端,10个跨膜螺旋区域和一个具有调节功能的C端亲水区域,其中氨氯吡嗪咪敏感基序和CaM结合域也是保守的。在4和5的螺旋区域之间,存在有一串带负电荷氨基酸,显示出有规律的排列模式,这些模式在生物界中的Na^+/H^+转运蛋白中是保守的。结合亲疏水资料,我们认为Na^+/H^+转运通道结构可能存在于这一区域。另外,也分析了RpNHX1可能的糖基化、酰基化和磷酸化位点。从这些数据中可以看出,RpNHX1可能在细胞中起到Na^+区隔化作用。

主 题 词:Na^+/H^+逆向转运蛋白基因 盐胁迫 生物信息学分析 刺槐 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 0907[农学-草药学] 07[理学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D O I:10.3969/j.issn.1672-416X.2007.06.005

馆 藏 号:203871019...

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