甘蔗SoNIN1基因结构及其内含子信息分析

作     者：牛俊奇 吴朝兴 杨丽涛 李杨瑞 Niu Junqi;Wu Chaoxing;Yang Litao;Li Yangrui

作者机构：广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室南宁530005 中国农业科学院甘蔗研究中心广西农业科学院甘蔗研究所农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室广西甘蔗遗传改良重点实验室广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室南宁530007 

基　　金：国家"863"计划课题(2013AA102604) 广西自然科学基金项目(2011GXNSFF018002 2013NXNSFAA019073) 国家国际合作项目(2009DFA30820 2013DFA31600) 广西八桂学者和特聘专家专项经费 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2014年第30卷第12期

页      码：147-152页

摘      要：根据前期克隆得到的So NIN1基因的全长c DNA和部分启动子序列设计引物,应用PCR技术从甘蔗叶片g DNA中克隆So NIN1基因,并利用生物信息学方法分析基因的结构。结果表明,So NIN1基因的DNA序列长4 938 bp,包含6个外显子和5个内含子,Gen Bank登录号KF563902。在该基因5 非翻译区存在一个268 bp内含子序列,同时5个内含子序列中含有与低温、干旱和激素等胁迫响应相关的作用元件,这些可能对So NIN1基因转录表达起调控作用。依据So NIN1蛋白聚类和外显子-内含子基因结构可以将植物NINs分为两类。

主 题 词：甘蔗 中性/碱性转化酶 外显子 内含子 信息分析 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2014.12.024

馆 藏 号：203874266...