核心蛋白和非结构蛋白5B直接测序法对丙型肝炎病毒基因分型的影响

作     者：李威 宁会彬 康谊 靳秀 刘俊平 尚佳 Li Wei;Ning Huibin;Kang Yi;Jin Xiu;Liu Junping;Shang Jia

作者机构：河南省人民医院感染性疾病科郑州450003 

基　　金：国家临床重点专科建设项目(2013年度) 河南省医学科技攻关计划普通项目(201003107) 河南省医学科技攻关计划省部共建项目(201401015) 

出 版 物：《中华传染病杂志》 (Chinese Journal of Infectious Diseases)

年 卷 期：2015年第33卷第6期

页      码：343-346页

摘      要：目的分析HCV核心蛋白（Core）和非结构蛋白（NS）6B区直接测序的敏感性和准确性。方法收集慢性丙型肝炎患者血清51份，采用反转录PCR对Core和NS5B区分别扩增，产物直接测序，构建进化树进行基因分型。结果51份样本中，Core区扩增阳性49份，占96．1％。共检出5种基因亚型：1b为61．2％（30／49），2a为20．4％（10／49），2b为2．0％（1／49），3a为4．1％（2／49），6a为12．2％（6／49）。NSSB区扩增阳性45份，占88．2％。1b、2a、2b、3a、6a分别占62．2％（28／46）、20．0％（9／45）、2．2％（1／45）、4．4％（2／45）和11．1％（6／46）。结论与NS5B区相比，Core区引物设计容易，扩增效率和分型成功率较高，可作为HCV基因型流行病学调查和临床研究的优先选择。

主 题 词：肝炎病毒属 基因型 病毒核心蛋白质类 非结构蛋白5B 

学科分类：1004[医学-公共卫生预防医学类] 100401[100401] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2015.06.007

馆 藏 号：203874509...