基于RNA-seq的db/db小鼠大脑皮质的转录组学分析

作     者：郭宝璐 白涛 郭杰 刘萌萌 杨彩红 章毅 范彦英 GUO Bao-lu;BAI Tao;GUO Jie;LIU Meng-meng;YANG Cai-hong;ZHANG Yi;FAN Yan-ying

作者机构：山西医科大学基础医学院药理教研室 

基　　金：国家自然科学基金(81872854) 2018年山西省高等学校科技创新项目(STIP) 山西省重点学科建设经费(FSKSC) 山西省‘1331工程’重点学科建设计划经费(1331KSC) 

出 版 物：《基础医学与临床》 (Basic and Clinical Medicine)

年 卷 期：2020年第40卷第1期

页      码：16-23页

摘      要：目的通过对db/db和野生型(WT)小鼠大脑皮质组织全转录组学分析,探索参与调节2型糖尿病诱导的脑功能障碍的差异表达基因(DEGs)及相关通路和网络。方法取雄性野生型WT和db/db小鼠各9只,在第8和24周检测小鼠的体质量和血糖,之后收集动物大脑皮质进行全转录组测序(RNA-seq),并进行DEGs,GO、KEGG及蛋白互作网络分析。结果与WT组相比,db/db组大脑皮质发生变化的306个转录本中有178个表达上调,128个表达下调。DEGs中,43个上调(如Clcnka和Trim17),59个下调(如Arih1和Nectin-3)。蛋白互作网络图中的13个枢纽基因均下调,且大多属于线粒体编码家族。同时,db/db小鼠在多项GO富集类别中具有显著差异,如细胞过程、细胞部分等。此外,KEGG功能富集结果显示DEGs在代谢、帕金森病(PD)、阿尔茨海默病(AD)等相关通路中高度富集,且这些富集通路中的DEGs主要影响了线粒体氧化磷酸化过程。结论揭示了2型糖尿病与中枢神经系统损伤之间的关系及潜在的相关基因、通路及网络。

主 题 词：转录组测序 2型糖尿病 大脑皮质 脑功能障碍 

学科分类：1001[医学-基础医学] 100104[100104] 10[医学] 

D　O　I：10.16352/j.issn.1001-6325.2020.01.005

馆 藏 号：203878541...