水牛PPARG来源环状RNA的鉴定及表达谱分析

作     者：冯雪 洪慧颖 孙晓菲 亐开兴 黄必志 魏雪锋 马云 黄洁萍 FENG Xue;HONG Huiying;SUN Xiaofei;QU Kaixing;HUANG Bizhi;WEI Xuefeng;MA Yun;HUANG Jieping

作者机构：信阳师范学院生命科学学院信阳464000 云南省草地动物科学研究院昆明650212 

基　　金：国家自然科学基金青年项目(31702094) 河南省高校重点项目(18A230013) 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2019年第46卷第12期

页      码：3457-3465页

摘      要：为鉴定前期转录组测序分析结果的可靠性,并从中挖掘水牛脂肪沉积潜在环状RNA(circular RNA,circRNA),本研究对10个来源于过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)基因的circRNA进行鉴定,根据测序获得的候选circRNA序列信息,设计对向引物进行半定量检测和普通测序以获得真实存在的circRNA,采用实时荧光定量PCR分析其在水牛不同组织和不同部位脂肪组织中的表达谱,半定量检测其在不同物种间的保守性。结果显示,10个候选circRNA中,有5个circRNA可以检测到,测序验证序列与转录组测序分析获得的序列一致,其中2个circRNA可设计出特异性的定量引物,这2个circRNA主要在脂肪组织中表达,且在不同部位脂肪组织中的表达量存在差异;另外3个circRNA在黄牛、牦牛、猪和小鼠的脂肪组织中均有表达,序列长度一致,序列相似度高。以上研究结果提示,转录组测序分析获得的结果可靠,其中有2个circRNA主要在脂肪组织中表达,且物种间保守,可作为研究水牛脂肪沉积的候选基因。

主 题 词：水牛 PPARG基因 环状RNA 鉴定 表达谱 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.16431/j.cnki.1671-7236.2019.12.001

馆 藏 号：203878618...