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禽流感病毒H3N8亚型野鸭源分离株基因特征

禽流感病毒H3N8亚型野鸭源分离株基因特征

作     者:王建琪 华育平 曾祥伟 张兰兰 程成 张玉稳 Wang Jianqi;Hua Yuping;Zeng Xiangwei;Zhang Lanlan;Cheng Cheng;Zhang Yuwen

作者机构:东北林业大学哈尔滨150040 

基  金:兽医生物技术国家重点实验室开放课题基金项目(SKLVBF200906) 国家林业局"野生动物疫源疫病本地调查"项目 

出 版 物:《东北林业大学学报》 (Journal of Northeast Forestry University)

年 卷 期:2011年第39卷第3期

页      码:92-95页

摘      要:根据已知禽流感病毒(AIV)的8个基因序列设计合成12对特异引物,通过反转录—聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,分别成功扩增出分离于野鸭(Mallard)的1株H3N8亚型禽流感病毒的全基因片段,将其分别克隆到pMD18-T载体后进行序列测定。同时将8个基因片段与GenBank发表的相应序列进行比较,绘制各基因的进化树。结果表明:所克隆到的8个片段均包含相应病毒基因的完整开放阅读框架,长度分别为PB2/2280、PB1/2276、PA/2150、HA/1734、NP/1497、NA/1413、MP/759、NS/838bp核苷酸,分别编码759、758、716、577、498、4702、52/962、30/125个氨基酸。A/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株HA有7个潜在糖基化位点;在HA裂解位点序列为PEKQTR↓GLF,无连续的多个碱性氨基酸插入,具有典型的低致病性禽流感病毒特征。根据A/mal-lard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株与参考毒株的序列比较分析结果推测,该分离株可能是不同亚型禽流感病毒通过互相基因交换所形成的基因重组体。

主 题 词:禽流感病毒 H3N8亚型 野鸭源分离株 序列分析 

学科分类:090603[090603] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1000-5382.2011.03.027

馆 藏 号:203878796...

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