猴源DDX3X基因的克隆及生物信息学分析

作     者：杨洪 田浪 张升波 张喜懿 温贵兰 程振涛 王开功 周碧君 YANG Hong;TIAN Lang;ZHANG Shengbo;ZHANG Xiyi;WEN Guilan;CHENG Zhentao;WANG Kaigong;ZHOU Bijun

作者机构：贵州大学动物科学学院预防兽医实验室贵州贵阳550025 贵州省动物生物制品工程技术研究中心贵州贵阳550016 

基　　金：国家自然科学基金项目“P-body在PRRSV复制和持续感染过程中的作用机制研究”(31460668) 贵州省科学技术基金项目“NSP2亚类在PRRSV复制过程中的作用机制研究”[黔科合J字(2015)2046] 

出 版 物：《贵州农业科学》 (Guizhou Agricultural Sciences)

年 卷 期：2019年第47卷第12期

页      码：70-75页

摘      要：为猴源DDX3X基因与相关病毒作用机理的深入研究奠定基础,根据Gen Bank预测的猪源DDX3X基因序列(登录号HQ266638)设计合成特异性引物,采用RT-PCR从猴源肾细胞中扩增DDX3X基因,将其克隆至pMD-19T载体测序,并对其进行生物学特征分析。结果表明:克隆的猴源DDX3X基因全长1989 bp,与猕猴的核苷酸序列同源性达99.6%,与绿猴、猕猴和人并列在同一遗传进化分支上,与三者的一致性较高;蛋白编码有662个氨基酸,共计20种氨基酸;甘氨酸含量最高,为11.5%,理论等电点为6.73;猴源DDX3X基因含有DEAD-Like解旋酶超家族结构域和C端结构域,DDX3X蛋白具有良好的亲水性,二级、三级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。猴源DDX3X基因与多个调节细胞进程、RNA加工的关键蛋白存在相互作用。

主 题 词：DDX3X基因 猴源肾细胞 T克隆 生物信息学分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

馆 藏 号：203880023...