鸡Prox1基因的克隆与生物信息学分析

作     者：袁超 高洪波 邓珊珊 段志强 YUAN Chao;GAO Hongbo;DENG Shanshan;DUAN Zhiqiang

作者机构：贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州大学动物科学学院贵州贵阳550025 

基　　金：国家自然科学基金项目(31760732、31502074) 贵州省科技计划项目(黔科合平台人才5788号) 贵州省农业攻关项目(黔科合支撑2588号) 

出 版 物：《中国家禽》 (China Poultry)

年 卷 期：2019年第41卷第23期

页      码：15-20页

摘      要：为克隆鸡Prox1基因CDS区序列并进行生物信息学分析,根据GenBank已发表的鸡Prox1基因序列设计合成引物,以鸡眼睛提取的总RNA反转录产物为模板,通过PCR扩增Prox1基因CDS区,利用生物信息学软件,对其理化性质、蛋白结构和系统进化树进行分析。结果从鸡眼睛中成功扩增出鸡Prox1基因CDS区。测序结果显示,鸡Prox1基因CDS区全长2 211 bp,共编码736个氨基酸,理论pI 6.62,相对分子质量约为82.86 ku,分子式为C3601H5671N(1049O1136S32。序列分析表明,鸡Prox1蛋白二级结构主要是由无规则卷曲(占53.67%)和α螺旋组成(占39.40%);鸡Prox1蛋白主要定位在细胞核,与其互作的细胞蛋白主要有LYVE1、PAX6、KDR、VEGFC和FLT4。核苷酸同源性及遗传进化分析发现:鸡与鹌鹑Prox1基因核苷酸同源性最高(为97.8%),并且与鹌鹑的亲缘关系最近。研究结果为进一步研究鸡Prox1蛋白调控鸡眼睛发育的机理奠定了基础。

主 题 词：鸡 Prox1 克隆 生物信息学 

学科分类：0905[农学-林学类] 09[农学] 090501[090501] 

D　O　I：10.16372/j.issn.1004-6364.2019.23.003

馆 藏 号：203880873...